Türkiye'de yayılış gösteren paronychıa mıll. cinsine ait bazı taksonların nrDNA ıts bölgeleri bakımından karşılaştırılması

Abstract

Bu çalışmada Paronychia Mill. (Caryophyllaceae) cinsine ait 34 takson (51 popülasyon) nrDNA ITS bölgesi üzerinden incelenmiştir. İncelenen taksonlardan 20'si ülkemizin önemli gen kaynaklarından biri olarak kabul edilen endemik türlerdir. DNA izolasyonunda kullanılan sağlıklı yaprak örnekleri TÜBİTAK tarafından desteklenen proje kapsamında 2012-2013 yıllarında toplanmıştır. İncelenen her bir popülasyona ait ITS bölgeleri evrensel ITS primerleri kullanılarak çoğaltılmış ve baz dizin analizleri hizmet alımı yolu ile gerçekleştirilmiştir. Yapılan analizler sonucunda incelenen örneklerin nrDNA ITS bölge uzunluklarının 635-671 bç, % GC içeriğinin 59,2-62,3 ve Pürin/Pirimidin oranı 1,027-1.088 arasında değiştiği bulunmuştur. Çalışılan taksonların nrDNA ITS dizinleri 142 (% 20)'sı parsimonik (bilgi verici), 230 (% 32)'si değişken ve 431 (% 59)'unun korunmuş (değişmeyen) bölge içerdiği bulunmuştur. İncelenen taksonlardan P.argentea var. argentea ve P. kayseriana' nın % 75,7' lik benzerlik düzeyiyle birbirine en uzak, P. davisii, P. adalia, P. lycica'nın' nin % 100' lük benzerlik düzeyiyle birbirine en yakın taksonlar olduğu tespit edilmiştir. İncelenen taksonların nrDNA-ITS bölgesinin % GC içeriklerin de birbirine en uzak taksonlar P. argentea var. scariarissima ve P. carica var. stipulata iken, en yakın taksonlar ise P. davisii, P. adalia, P. lycica, P. carica olduğu tespit edilmiştir. Baz dizilerin filogenetik programlar ile değerlendirilmesi sonucu çalışılan taksonlar arası akrabalık ilişkileri belirlenmiş ve Paronychia cinsinin polifiletik bir yapıya sahip olduğunu destekleyen bir filogenetik yapıya sahip olduğu bulunmuştur.