Rekombinant böcek iridovirüsünün oluşturulması ve karakterizasyonu

Abstract

Chilo iridescent virus (CIV), zararlı böcekler arasında oldukça geniş konak spektrumuna sahip olan Iridoviridae familyasına ait bir böcek virüsüdür. DNA genomunun dizin analizi gerçekleştirilmiş ve genom uzunluğu 212,482 nükleotit olarak belirlenmiştir. Hücre kültürüne uyarlanabilmiş ve çok sayıda hücre suşunda düşük seviyede de olsa replike olduğu belirlenmiştir. Virüs genomuna yabancı bir geni yerleştirebilmek için genomda bir yer açılması yani genomdan mevcut bir genin/bölgenin çıkarılması gerekmektedir. Ancak genomdan çıkarılacak genin yokluğu virüs replikasyonunu veya virüse ait önemli diğer bir mekanizmayı etkilememelidir. Biyoinformatik analizlere göre apoptozis inhibitör genleri arasında bulunmasına rağmen ORF 157L'nin fonksiyonel olmadığı belirlenmiştir. Bu tezde, ilk defa bir rekombinant iridovirüsün oluşturulması ve karakterize edilmesi gerçekleştirilmiştir. Homolog rekombinasyon ile oluşturulan rekombinant (rCIVΔ157L-gfp) iridovirüs CIV mcp pormotoru altında bir raportör gen olan yeşil floresan proteini geni (gfp)'ni başarılı bir şekilde ifade etmiştir. 157L geni yerine yerleştirilen gfp'nin virüs replikasyonunu etkilemediği gösterilmiştir. Rekombinant CIV ile enfeksiyon esnasında viral replikasyon ve üretim yaban tip CIV ile benzer bir durum oluşturmuştur. Sonuç olarak CIV 157L gen bölgesinin biyolojik mücadele ve biyoteknolojik amaçla yabancı DNA'ların yerleştirilebileceği bir bölge olarak kullanılabileceği söylenebilir.