Yersinia ruckeri'nin lipopolisakkarit ve dış membran protein profillerinin belirlenmesi

Abstract

Bu çalışmada Yersinia ruckeri?ye ait 40 suşun lipopolisakkarit (LPS) ve dış membran protein profilleri (DMP) sodyum dodesil sülfat poliakrilamid jel elektroforezi (SDS-PAGE) tekniği ile belirlenerek izolatlar arasındaki benzerlik araştırılmıştır. Ülkemizin değişik yöreleri ile ABD ve İtaya?dan izole edilen Y. ruckeri suşları incelenmiştir. Y. ruckeri izolatının tanımlanması amacıyla biyokimyasal testler uygulanmıştır. Klasik yöntemlerin uygulandığı testlerde suşlar arasında tam homojeniteye rastlanmamıştır. Benzerlik oranları düşük bulunan Y. ruckeri suşları LPS ve DMP analizinde 14 kümede toplanmıştır. Türkiye?den izole edilen suşlar hem LPS hem de DMP dendogramında ABD ve İtalya suşlarının arasında olduğu saptanmıştır. Yurtdışı suşları ile Türkiye?den izole edilen suşların benzerlik oranlarının %60 civarında olduğu tespit edilmiştir. Sonuç olarak 40 suşa ait veriler benzerliklerine göre karşılaştırıldığında, biyotip, LPS ve DMP profilleri arasında belirgin bir ilişki bulunamamıştır.