Kuzey Anadolu bölgesinde doğal olarak yayılış gösteren bazı Hieracium L. (Asteraceae) taksonlarının nrDNA its bölgeleri bakımından karşılaştırılması

Abstract

Bu çalısmada, 23 dogal Hieracium L. (Asteraceae) taksonuna ait 47 populasyon örnegi, nrDNA ITS bölgeleri açısından arastırıldı. Çalısmada kullanılan bitki materyalleri 1999?2006 vejetasyon döneminde Kuzey Anadolu Bölgesi'nden toplandı. ITS çalısmalarında kullanılmak üzere saglam ve olgun yapraklarından genomik DNA izolasyonu gerçeklestirildi. Toplanan taksonların ITS bölgeleri evrensel ITS primerleri kullanılarak çogaltıldı ve baz dizin analizleri gerçeklestirildi. Örnekler arasında, ITS bölge uzunlugunun 706?713 bp arasında degistigi, baz varyasyon oranlarının % 0?6 arasında farklılık gösterdigi tespit edildi. NCBI GenBank verileri kullanılarak, CLUSTAL-W programı yardımıyla örneklerin ITS bölgelerinin ITS1, ITS2 ve 5.8S nrDNA bölgeleri belirlenmistir. ITS1 bölgesi 281?287 bp, ITS2 bölgesi 264?266 bp ve 5.8S nrDNA bölgesi 166 bp uzunlugunda bulunmustur. Daha sonra ITS sekansları analiz islemlerinde kullanılmak üzere alt alta hizalandı. Tüm örneklere ait ITS baz sıraları MEGA 3.1 programı kullanılarak analiz edildi ve populasyonlar arasındaki akrabalık iliskilerini gösteren parsimoni agacı olusturuldu. Baz analizi sonucu elde edilen moleküler verilerin daha önceki morfolojik verilerle uygunlugu belirlenmeye çalısıldı.