http://acikerisim.ktu.edu.tr/jspui/handle/123456789/286 2026-04-18T12:53:12Z http://acikerisim.ktu.edu.tr/jspui/handle/123456789/3366 Title: Yeni nesil dizileme yöntemiyle elde edilen sekanslarda okuma hatalarının tespiti ve düzeltilmesi Authors: Dilek, Gökhan Abstract: Biyoinformatik çalışmalar; genetik hastalık araştırmaları, hastalık tespiti ve tespit edilen hastalıklara çözüm üretilebilmesi amacıyla DNA dizilimleri yöntemleri üzerinde yoğunlaşmıştır. Genetik verilerin analizindeki temel problemler, bu veri dizilimlerinin boyutlarına bağlı karmaşıklıklarından meydana gelmektedir. Bu karmaşıklık, Yeni Nesil Dizileme (YND) cihazları tarafından yapılan veri okuma hatasından kaynaklanmaktadır. Büyük veri dizilimlerinin tek seferde okunması mümkün olmadığından, verilerin parçalar halinde dizileme yapılabilmektedir. YND cihazları yardımıyla büyük genetik verilerinin okunması mümkün kılınmıştır. Ayrıca YND cihazları, genetik veri dizilimlerinin okunması sırasında %1 ile %3 arasında hatalı okuma gerçekleştirmektedir. Bu çalışmada, günümüzde en yaygın kanser hastalıklarından biri olan Braf Mürin Sarcoma Viral Onkogen Homolog B1 (BRAF) gen mutasyonunun tespiti için sıkça rastlanan veri okuma hatasının düzeltilmesi üzerine bir yöntem önerilmiştir. Bu yöntemde, Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI) üzerinden paylaşılan sağlıklı BRAF geni kullanılmıştır. YND okumaları simüle edilerek oluşan hata oranları ile orantılı sentetik veri üretilmiştir. Hatalı gen, belirlenen derinlik boyutunda okunmuş ve fasta formatında kaydedilmiştir. Referans dizilim ile sekanslar karşılaştırılmış ve hatalar tespit edilerek düzeltme işlemleri uygulanmıştır. 2021-03-01T00:00:00Z http://acikerisim.ktu.edu.tr/jspui/handle/123456789/3365 Title: Modren attendance moni̇toring system Authors: Arafat, Ameer Abstract: For the betterment of e-education quality, monitoring the attendance of students is a very important part of the modern education system. Manual filling of traditional attendance sheets can raise many inconvenient issues. To avoid these issues, we come up with the idea of an attendance system that uses the fingerprints of the students to monitor their attendance. This study aims to make it easier and more accurate for both the teachers and the students to examine. There are two possible methods for an attendance management system. The first method is that the teacher calls all students' names, which takes a lot of lesson time. The other one is to give the attendance sheet to the students in the lecture class, asking them to write their names and place their signatures on it; in this method, some students can sign instead of other students who are not present in the course. Such methods can lead to the problem of inaccurate attendance records. the students can calculate their attendance by entering their student number and password on the website which created for that. Within the scope of the study, it is possible to prevent the inconveniences of the traditional attendance system in schools, universities, and offices. At the same time, it aims to prevent time-consuming tasks such as organizing the transaction using the polling system and recording it. With the proposed tool, it will be sufficient to monitor the attendance of students in schools and universities and there will be no waste of time in attendance calculation. This system can replace the traditional participation system when it is used in all schools in the future, in which case the arrangement of the attendance can be done very easily and quickly, and reports can be issued easily. 2021-08-01T00:00:00Z http://acikerisim.ktu.edu.tr/jspui/handle/123456789/3364 Title: Dokunmatik ekranlarda kaydırma biyometrisine dayalı kimlik doğrulama çalışmaları Authors: Sivaz, Orhan Abstract: Bilgi güvenliğini sağlamak için günümüzde çeşitli biyometrik doğrulama sistemleri kullanılmaktadır. Bunlardan biri de son zamanlarda popüler olan dokunmatik ekran biyometrilerinden kaydırma biyometrisidir. Kaydırma biyometrisi diğer fizyolojik biyometrilerden farklı olarak ek bir donanım gerektirmez ve kullanıcıyı dokunmatik ekranlar üzerinde yaptığı kaydırma hareketlerinden arka planda sürekli olarak tanımayı amaçlar. Bu çalışmada, kaydırma hareketlerindeki karakteristik farklılıklarını ön plana çıkartacak yaklaşımların geliştirilmesi hedeflenmiştir. İlk olarak, ham kaydırma verilerinden elde edilen istatistiksel özelliklerin arttırılmasının performans üzerindeki etkisi araştırılmıştır. Daha sonra, ÇYKİ, SR-ÇDA, ÇTBA ve ÇDA gibi en güncel özellik çıkartma ve EKK-DVM, GKM, ÇKP ve AK-EYK gibi yaygın kullanılan sınıflandırma yöntemlerinin kaydırma biyometrisinin doğrulama çalışmaları üzerindeki etkisi incelenmiştir. Ayrıca, skor seviyesinde sınıflandırma yöntemlerinin birleştirilmesinin; tek bir kaydırma hareketi yerine çoklu kaydırmaya dayalı doğrulamanın ve ham verilerden farklı tekniklerle örüntü oluşturarak ESA ile örüntü bazlı doğrulamanın etkileri incelenmiştir. Performans analizleri için literatürde yaygın kullanılan farklı karakteristiklere sahip 3 farklı veri setinden (Serwadda, JSS18 ve Umdaa) yararlanılmıştır. 2021-01-01T00:00:00Z http://acikerisim.ktu.edu.tr/jspui/handle/123456789/3363 Title: Dağıtık 6TiSCH ağlarında kaynak yönetimi Authors: Dehghan, Parivash Abstract: Nesnelerin I ̇nterneti, kaynak kısıtlı ve düs ̧ük güçlü cihazların herhangi bir protokol dönüs ̧türücüsü olmadan in- ternete çıkmasını sag ̆lamayı hedefleyen teknolojilerin bütünü olarak düs ̧ünülebilir. Bu teknolojiyi içeren ag ̆larda yog ̆un haberles ̧me trafig ̆i meydana gelebilir. Bu trafik, tıkanıklıg ̆a neden olur. Tıkanıklık, ag ̆ın performansını ve hizmet kalite- sini önemli ölçüde etkiler. Bu bildiride, Java tabanlı denet- leyici mekanizması gelis ̧tirilerek, zaman paylas ̧ımlı ve kanal atlamalı bir ag ̆ teknolojisi olan IETF 6TiSCH protokolüne eklenti sunulmus ̧tur. Önerilen mekanizma, frekans kanallarını ag ̆ geçitlerinin yog ̆unlug ̆una göre dikey biçimde her bir ag ̆ geçidine atamaktadır. Bu sayede hem koms ̧u 6TiSCH ag ̆larının birbirlerine olan çakıs ̧ma etkilerinin önüne geçilmektedir hem de veri iletim bas ̧arısında da artıs ̧ sag ̆lanılmaktadır. Gelis ̧tirilen kaynak ayırma mekanizmasının geçerlilig ̆i Contiki OS ve Cooja simülatörü kullanarak test edilmis ̧tir 2020-11-01T00:00:00Z